Het Hubrecht Instituut is een onderzoeksinstituut van de Koninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen (KNAW) dat onderzoek doet op het gebied van de ontwikkelingsbiologie in het algemeen en stamcellen in het bijzonder. Het instituut is gevestigd in Utrecht op het Utrecht Science Park. Het instituut is genoemd naar professor Ambrosius Hubrecht (1853-1915).